Como parte de su política de fortalecimiento y mejoramiento continuo, la Facultad de Medicina ha fomentando activamente el desarrollo de actividades de autoevaluación al interior de su comunidad universitaria.
Lo anterior ha permitido la acreditación de todas sus carreras de pregrado y del Magíster en Salud Pública. Así también, ha iniciado con éxito los procesos de acreditación de algunas de sus programas de especialidades médicas:
| Carrera | Estado de Acreditación | Desde – Hasta | Agencia Acreditación Vigente |
| Medicina | Acreditada | 6 años | AACS |
| 6 Dic. 2012 – 6 Dic. 2018 | |||
| Enfermería | Acreditada | 5 años | Acredita Acción |
| Mar. 2017 – Marz. 2022 | |||
| Nutrición y Dietética | Acreditada | 6 años | Acredita Acción |
| 21 Dic. 2016 – 21 Dic. 2022 | |||
| Kinesiología | Acreditada | 5 años | AACS |
| 10 Abr. 2013 – 10 Abr. 2018 | |||
| Magíster en Salud Pública | Acreditada | 4 años | ADC |
| Dic. 2015 – Dic. 2019 | |||
| Programa Cirugía General | Acreditado | 5 años | APICE |
| 7 Nov. 2014 – 7 Nov. 2019 | |||
| Programa Medicina Interna | Acreditado | 5 años | APICE |
| 7 Nov. 2014 – 7 Nov. 2019 | |||
| Programa de Pediatría | Acreditado | 3 años | APICE |
| 14 Oct. 2016 – 14 Oct. 2019 |